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A alta velocidade de disseminação do novo coronavírus representa um desafio para pesquisadores. Então, o supercomputador mais rápido do mundo, Summit da IBM, foi usado para analisar qual medicamento pode impedir o SARS-CoV-2 de infectar células hospedeiras, com maior eficiência.
Uma dupla de cientistas fez simulações com mais de 8 mil substâncias. A pesquisa foi apresentada em artigo publicado no servidor de pré-impressões ChemRxiv.
Os resultados representam um primeiro passo, o que não significa que foi encontrada uma cura ou tratamento para o novo coronavírus. No entanto, o diretor do Laboratório Nacional Oak Ridge, Jeremy Smith, declarou que a equipe está esperançosa de que as descobertas do computador possam contribuir para estudos futuros, além de fornecer uma estrutura para investigar melhor as substâncias indicadas pelo computador.
A tarefa dada ao supercomputador foi de encontrar substâncias que poderiam se ligar à proteína Spike do vírus, usada para infectar as células hospedeiras. Ao tornar a proteína ineficiente, o vírus não conseguiria se espalhar.
Os pesquisadores fizeram a simulação de como as partículas da proteína reagiriam a diferentes substâncias. Depois reduziram a lista de 77 resultados para sete alternativas mais promissoras. Estas foram consideradas possibilidades razoáveis para investigações quanto à capacidade de limitar as interações entre o vírus SARS-CoV-2 e o hospedeiro.
Como próximo passo, os pesquisadores planejam realizar nova simulação com um modelo de proteína spike muito preciso do novo vírus identificado por outros pesquisadores. [Futurism, Oak Ridge National Laboratory, ChemRxiv]
Supercomputador mais rápido do mundo busca a cura do coronavirus
Os biofísicos da Universidade do Tennessee usaram o supercomputador SUMMIT, construído pela IBM, para filtrar milhares de moléculas e encontrar possíveis compostos que poderiam ser usados como uma nova droga contra o COVID-19.
Após alguns dias de cálculos, o supercomputador conseguiu encontrar pelo menos 77 compostos que indicam que eles poderiam potencialmente ajudar a impedir que o SARS-CoV-2 invadisse as células humanas.
As descobertas foram publicadas recentemente em um artigo disponível no servidor de pré-impressão ChemRxiv.
Isso significa que o trabalho está aguardando a revisão por pares, portanto a pesquisa deve ser considerada um “trabalho em andamento”.
As superfícies dos coronavírus são cobertas por proteínas parecidas com coroas (daí o nome) que permitem que os vírus se liguem e infectem células humanas, um pouco como uma chave e fechadura.
O composto, cinza, foi calculado para se ligar à proteína spike SARS-CoV-2, mostrada em ciano, para impedir que ela se ancore no enzima de conversão da angiotensina humana 2, ou receptor ACE2, mostrado em roxo.
Ao entender as proteínas dos vírus e os receptores das células humanas, bem como a maneira como outros compostos químicos interagem com eles, é possível descobrir como as drogas podem ser eficazes contra o patógeno.
O SUMMIT foi usado para analisar profundamente um banco de dados de mais de 8.000 compostos conhecidos de medicamentos, produtos químicos, fitoterápicos e produtos naturais existentes.
Seu trabalho era farejar compostos que parecem capazes de se ligar aos picos de proteína SARS-CoV-2, bloqueando a chave do vírus e teoricamente impedindo-o de invadir as células do corpo.
“Levamos um dia ou dois, enquanto levaria meses em um computador normal”, disse o autor do estudo Jeremy Smith, diretor do Centro de Biofísica Molecular da Universidade do Tennessee, em comunicado.
Obviamente, não há garantia de que nenhum dos compostos encontrados pelo supercomputador seja eficaz na prática
Além disso, assim como qualquer medicamento, será necessário extensos testes e ensaios clínicos antes de ser considerado um tratamento viável.
No entanto, o trabalho do supercomputador ajudou a identificar alguns candidatos promissores para os pesquisadores acompanharem. “Nossos resultados não significam que encontramos uma cura ou tratamento para o SARS-CoV-2”, disse Smith.
O Supercomputador da IBM e NVIDIA ajudam a identificar compostos que podem guiar os pesquisadores para a cura do coronavirus
“Estamos muito esperançosos de que nossas descobertas computacionais informem estudos futuros e forneçam uma estrutura que os experimentalistas usarão para investigar melhor esses compostos. Só então saberemos se algum deles apresenta as características necessárias para mitigar esse vírus. ”
SUMMIT é descrito como a “Fórmula 1 dos supercomputadores”. Encontrado no Laboratório Nacional de Oak Ridge, no Tennessee, o supercomputador é do tamanho de duas quadras de tênis e é capaz de processar mais de 200 quatrilhões de cálculos por segundo.
É usado por uma variedade de pesquisadores diferentes para uma variedade de missões nobres, desde modelagem de supernovas e meio ambiente até dados detalhados sobre câncer e genética. Esta pesquisa não é a primeira a usar um computador para encontrar novos medicamentos.
No mês passado, os pesquisadores usaram um novo algoritmo de computador para vasculhar um vasto arquivo digital de mais de 100 milhões de compostos químicos e descobriram uma molécula que parecia possuir propriedades antibióticas verdadeiramente notáveis.
A Microsoft lançou, neste domingo (15), um mapa ao vivo que rastreia os casos de coronavírus em todo o mundo, mostrando dados atualizados por país, incluindo o número total de infectados, a quantidade de recuperados e as mortes, entre outras informações.
Criado pela equipe do buscador Bing, o rastreador do Covid-19 utiliza dados de fontes como a Organização Mundial da Saúde (OMS), o Centro de Controle e Prevenção de Doenças dos Estados Unidos (CDC) e o Centro Europeu de Prevenção e Controle de Doenças (ECDC).
Além de indicar o número de casos ativos, recuperados e fatais, a ferramenta disponibiliza as últimas notícias sobre o coronavírus, com vídeos informativos sobre o Covid-19, formas de prevenção e outros detalhes que podem ajudar a evitar o pânico.
A ferramenta é uma fonte de consulta interessante sobre o avanço da doença.
No caso dos Estados Unidos, o mapa é ainda mais detalhado e completo, pois permite verificar as informações por estado, enquanto nos demais países os dados são apresentados de maneira geral.
Como acessar
Para conferir o conteúdo ao vivo do coronavírus criado pela Microsoft, basta acessar o site https://www.bing.com/covid. É possível conferir as informações no canto esquerdo ou navegar pelo mapa, passando o cursor do mouse sobre o país desejado para verificar os detalhes.
Clicando sobre um dos países, é exibido um menu com informações mais detalhadas da região, além das últimas notícias locais sobre o avanço do Covid-19.
De acordo com a ferramenta, são 173.545 casos confirmados em todo o mundo, dos quais 89.094 são ativos, 77.777 recuperados e 6.674 fatais. A China continua com o maior número de infectados (80.860), seguida pela Itália (24.747) e pelo Irã (14.991). No Brasil já são 203 casos.
